Đại chiến Tokyo là câu chuyện về một cuộc tấn công vào Cầu Rainbow ở Odaiba, Tokyo xảy ra, Grey Ghost bị đánh cắp, thủ phạm chính đã theo dõi Yukihito Tsuge. Mười ba năm trước, Yukihito Tsuge đã lên kế hoạch cho một cuộc đảo chính ở Tokyo. Đội trưởng của Xe số 2, Keiji Gotoda đang cố gắng ngăn chặn âm mưu đảo chính này của Yukihito Tsuge.