Đó là năm 2071. Sau một vụ đánh bom khủng bố, một loại virus chết người được phát tán trên sao Hỏa và chính phủ đã ban hành một khoản tiền thưởng lớn nhất trong lịch sử, để bắt giữ bất cứ kẻ nào đứng sau nó. Nhóm thợ săn tiền thưởng của tàu vũ trụ Bebop; Spike, Faye, Jet và Ed, tiếp nhận vụ việc với hy vọng kiếm được tiền thưởng. Tuy nhiên, bí ẩn xung quanh người đàn ông chịu trách nhiệm, Vincent, đi sâu hơn những gì họ tưởng tượng, và họ không phải là những người duy nhất săn lùng anh ta.