Khi Justice League mất tích và những kẻ phản diện tràn ngập Metropolis, chỉ có một đội có thể giải quyết bí ẩn này: Scooby-Doo và băng đảng! Nhưng chờ đã, có một chú chó mới trong thị trấn – Krypto – Siêu nhân của Siêu nhân với Siêu năng lực. Mystery Inc. sẽ cần mọi sự trợ giúp có thể khi các bóng ma đe dọa trụ sở của Justice League.