Huyền thoại tiếp tục phát triển mạnh mẽ hơn trong siêu mùa thứ hai của Smallville. Xuyên suốt 23 tập của mùa phim, Clark Kent vật lộn với tiếng gọi của mình khi anh khám phá nguồn gốc thực sự của mình: anh được gửi đến Trái đất để cứu nhân loại hay tiêu diệt nó? Giữa tất cả sự hỗn loạn, Lana và Clark ngày càng thân thiết hơn trước; Lex kết hôn; Lionel dụ Chloe về phía bóng tối; Kents nhận được tin tức kỳ diệu; và Pete trở thành người giữ bí mật của Clark.