Trong nháy mắt, toàn bộ nhân loại đã bị hoá đá bởi 1 hiện tượng kì bí. Phải đến vài nghìn năm sau, Senku – cậu thiếu niên có khả năng nghiên cứu khoa học trời sinh mới được thức tỉnh. Đối mặt với sự diệt vong của cả một nền văn minh do thế giới đá (Stone world) tạo ra, Senku đã quyết định dùng sức mạnh khoa học mà mình có để hồi sinh lại toàn bộ thế giới. Từ đó, những cuộc phiêu lưu mạo hiểm chưa từng có để tạo ra một thế giới mới đã được bắt đầu!