Sau khi di chuyển cách xa Trái đất hàng năm ánh sáng, tàu vũ trụ Macross chở một thành phố của thường dân và binh lính trở về nhà. Họ liên tục chống lại mối đe dọa từ Zentradi và Meltrandi, những chủng tộc ngoài hành tinh khổng lồ mà nhân loại gây chiến.